Запитвания

Биоинформатика

Биоинформатика

Лабораторията разработва иновативни решения в сферата на биоинформатиката, биоавтоматиката и биоинженерството и развива най-новите отрасли в областта на биотехнологиите, синтетичната и системната биология, биомедицинското приборостроене и анализа на биологични данни.

Предоставяни услуги

  • Изработка на микрофлуидни прототипи и други микроструктури;
  • Метагеномно ампликонно секвениране;
  • Shotgun метагеномно секвениране;
  • Целогеномно секвениране (WGS);
  • Изолиране на ДНК за NGS;
  • Обработка и анализ на NGS данни – от сурови прочити до готови графики и интерпретация;
  • Разработка на биоинформатичен софтуер;
  • Проектиране и изпитване на детектори за γ-, β- и рентгеново лъчение;
  • Софтуерна интеграция и изграждане на работни места за спектрометричен анализ;
  • Ремонт и поддръжка на радиометрична, дозиметрична и спектрометрична апаратура;
  • Консултации и съвместна разработка в областта на лъчевите технологии и радиационната биология;
  • Подобряване на щамове по спецификация на клиента;
  • Генетично манипулиране на микроорганизми по спецификация на клиента;
  • Съхранение на щамове;
  • Разработване на специализирана изследователска апаратура;
  • Проектиране и 3D печат на лабораторни уреди по заявка;
  • Изработка на образователни STEM комплекти –експерименти, устройства и методични материали;
  • Организиране на ученически и студентски практически занимания.

Основни дейности

Внедряване на най-новите технологии в области като генетика (следващо поколение ДНК секвениране, CRISPR), метагеномика, биомедицинско оборудване за репродуктивна медицина, микрофлуиди, нови биопроцеси и т.н.;
Дизайн и прототипиране на нови научни инструменти с фокус върху отворени технологии и локално производство, подходящи за low-resource лаборатории и образователни институции;
Разработване на нови поколения детектори – твърдотелни, органични сцинтилатори и високочувствителни полупроводникови сензори;
Разработка на достъпни лабораторни устройства (FirmaLab) на база микрофлуидната технология;
Работа с ампликонно и shotgun метагеномно секвениране за изследване на микробни общности;
Разработка на анализни пайплайни и автоматизирана обработка на геномни данни;
Метагеномика и NGS-базиран анализ;
Създаване на low-cost PCR апарати, микроскопи и инкубатори, съвместими със смартфони и USB захранване;
Дизайн и тест на open-source хардуер за образование и хоби наука;
Дизайн и прототипиране на нови научни инструменти с фокус върху отворени технологии и локално производство, подходящи за low-resource лаборатории и образователни институции;
Изследване на ефектите от ултравиолетово и йонизиращо лъчение (фотонно и бета) върху биологични обекти;
Разработка и тест на радиометрични и спектрометрични детектори на йонизиращи лъчения;
Интегриране на софтуер за анализ на гама и рентгенови спектри с цел създаване на високорезолюционни работни станции;
STEM образование и експериментални пакети;
Разработка на образователни комплекти с 3D-принтирани компоненти, протоколи и видеоинструкции за ученици и студенти;
Провеждане на практически обучения, демонстрации и училищни проекти;
Поддръжка на българските студентски отбори по синтетична биология за конкурса iGEM, чиито ежегодни финали се провеждат в Париж, Франция и откъдето отборът се е връщал вече 6 пъти с медали.

Публикации

First Detection and Genomic Characterization of Linezolid-Resistant Enterococcus faecalis Clinical Isolates in Bulgaria. Microorganisms. 2025; 13(1):195

Strateva TV, Hristova P, Stoeva TJ, Hitkova H, Peykov S. https://doi.org/10.3390/microorganisms13010195

Low-Cost Three-Dimensionally Printed Inverted Plug and Play Optical Instrument for Microfluidic Imaging. Micro. 2023; 3(2):537-548;

Markov D, Grigorov E, Kirov B, Denev JA, Galabov V, Marinov MB. https://doi.org/10.3390/micro3020036

Chapter 2 – Design and characterization of synthetic promoters, Editor(s): Vijai Singh, New Frontiers and Applications of Synthetic Biology, Academic Press, 2022, Pages 11-21,ISBN 9780128244692;

Boris Kirov, Slavil Peykov, https://doi.org/10.1016/B978-0-12-824469-2.00007-5

First detection of a colistin-resistant Klebsiella aerogenes isolate from a critically ill patient with septic shock in Bulgaria. Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica, 69(3), 209-214;

Peykov, S., Stratev, A., Kirov, B., Gergova, R., & Strateva, T. (2022). https://doi.org/10.1556/030.2022.01833

Novel Microfluidics Device for Rapid Antibiotics Susceptibility Screening. Applied Sciences. 2022; 12(4):2198;

Grigorov E, Peykov S, Kirov B. https://doi.org/10.3390/app12042198

Оборудване

  • Клетъчен брояч за живи и мъртви клетки;
  • Епифлуоресцентен микроскоп;
  • Обърнат контрастен микроскоп за живи клетки;
  • Фризер с контролирана скорост на охлаждане;
  • Система за криосъхранение с течен азот;
  • Автоматичен флуоресцентен скенер за биочипове;
  • Плазмочистач;
  • Интерферометър / профилометър;
  • UV/Vis спектрофотометър;
  • Флуориметър Quantus;
  • PCR;
  • Хоризонтални и вертикални електрофорези;
  • Ламинарен бокс;
  • PCR бокс;
  • Стандартно лабораторно оборудване за микробиология и молекулярна биология;
  • Биореактори.

Управление

Ръководител: : доц. д-р инж. Васил Гълъбов
Научни области:
Биоавтоматика, aвтоматизирани системи за обработка на информация и управление, aвтоматизация на производството
История:

През 1985 г. завършва Техническа и биомедицинска кибернетика в ТУ Илменау, Германия.
Специализира в лабораториите на Интеракустикс АД, Асенс, Дания.
Специализации и гост-преподавателска дейност в Карлсруйски технологичен институт, Германия.
Автор е на над 60 статии и публикации и участва в над 10 изпълнени проеки в сферата на научните си дейности.